Эта система надежно контролировала работу реактора и его безопасную эксплуатацию. Она обеспечивала пуск реактора, автоматическое поддержание заданного уровня мощности, управляла энерговыделением по высоте и радиусу активной зоны реактора, компенсировала выгорание топлива, обеспечивала защиту реактора во время аварийных ситуаций. В системе управления и защиты реактора использовалась аппаратура высокой надежности с интегральными схемами, предназначенная для приема и обработки сигналов различных датчиков, а также для информирования операторов о состоянии реактора. Мощность реактора и ее распределение оперативно регулировалась 211 стержнями из карбида бора, находившихся в каналах системы управления и защиты реактора. Для охлаждения стержней использовалась вода специального контура. 40 стержней используются для управления энерговыделением по высоте активной зоны реактора, другие 24 стержня выполняют функцию быстрой аварийной защиты. При возникновении аварийной ситуации аварийные стержни вводились в активную зону в течение 2,5 секунды.